《企業(yè)會計準則》和《企業(yè)財務(wù)通則》規(guī)定，對職工福利費取消了原制度按工資總額14%提取的規(guī)定，將實際發(fā)生的福利費用列入“職工薪酬”的范圍。企業(yè)可以根據(jù)實際情況采用先提取后使用的方法，但提取比例由企業(yè)根據(jù)自身實際情況合理確定。年末，如果當(dāng)年提取的福利費大于支用數(shù)的，應(yīng)予沖回，反之應(yīng)當(dāng)補提，同時修訂次年度福利費的提取比例；也可以按福利費實際發(fā)生額據(jù)實列支。會計處理上，取消了原來的“應(yīng)付福利費”一級科目，增設(shè)“應(yīng)付職工薪酬——職工福利”科目核算職工福利費。發(fā)生的福利費按照計算對象列入相關(guān)成本、費用科目。對企業(yè)按規(guī)定繳納的基本醫(yī)療保險和補充醫(yī)療保險費以及實際支付給員工的醫(yī)療費用作為職工福利費處理。另據(jù)《財政部關(guān)于企業(yè)加強職工福利費財務(wù)管理的通知》（財企[2009]242號）文規(guī)定：對中央企業(yè)以及事業(yè)單位繳納的基本醫(yī)療保險和補充醫(yī)療保險費不再納入職工福利費管理，而納入工資總額。即從2009年12月起，對中央企業(yè)以及事業(yè)單位實行醫(yī)療統(tǒng)籌企業(yè)的醫(yī)療保險費應(yīng)當(dāng)在“應(yīng)付職工薪酬——工資薪金”科目核算。對中央企業(yè)以及事業(yè)單位未實行醫(yī)療統(tǒng)籌企業(yè)的醫(yī)療保險費仍然應(yīng)當(dāng)在“應(yīng)付職工薪酬——職工福利”科目核算。
醫(yī)療費用在企業(yè)所得稅的稅前扣除上，應(yīng)區(qū)分不同情況分別處理。
一、職工基本醫(yī)療保險費的稅前扣除
根據(jù)《企業(yè)所得稅法實施條例》第三十五條規(guī)定：“企業(yè)依照國務(wù)院有關(guān)主管部門或者省級人民政府規(guī)定的范圍和標準為職工繳納的基本醫(yī)療保險費、工傷保險費、生育保險費等基本社會保險費準予扣除。并且對企業(yè)按規(guī)定繳納的醫(yī)療保險、補充醫(yī)療保險均不擠占福利費14%的指標，而應(yīng)當(dāng)按規(guī)定直接稅前扣除。而對超過規(guī)定標準繳納的社會保險，既不允許直接在稅前扣除，也不允許作為福利費14%的基數(shù)計算扣除。
在會計處理上，《企業(yè)財務(wù)通則》第四十三條規(guī)定：”企業(yè)應(yīng)當(dāng)依法為職工支付基本醫(yī)療、基本養(yǎng)老、失業(yè)、工傷等社會保險費，所需費用直接作為成本（費用）列支。已參加基本醫(yī)療、基本養(yǎng)老保險的企業(yè)，具有持續(xù)盈利能力和支付能力的，可以為職工建立補充醫(yī)療保險和補充養(yǎng)老保險，所需費用按照省級以上人民政府規(guī)定的比例從成本（費用）中提取。超出規(guī)定比例的部分，由職工個人負擔(dān)?！?br />
對中央企業(yè)以及事業(yè)單位實行醫(yī)療統(tǒng)籌企業(yè)的醫(yī)療保險費應(yīng)當(dāng)在”應(yīng)付職工薪酬——工資薪金“科目核算，但并不是說中央企業(yè)及事業(yè)單位按規(guī)定繳納的基本醫(yī)療保險及補充養(yǎng)老保險可以按工資薪金進行稅前扣除。財企[2009]242號文明確規(guī)定，在計算應(yīng)納稅所得額時，企業(yè)職工福利費財務(wù)管理同稅收法律、行政法規(guī)的規(guī)定不一致的，應(yīng)依照稅收法律、行政法規(guī)的規(guī)定計算納稅。
二、職工補充醫(yī)療保險費的稅前扣除
《企業(yè)所得稅法實施條例》規(guī)定，企業(yè)依照國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定的范圍和標準繳納的補充醫(yī)療保險費允許稅前扣除，超過范圍未和標準的不允許稅前扣除。而《財政部國家稅務(wù)總局關(guān)于補充養(yǎng)老保險費補充醫(yī)療保險費有關(guān)企業(yè)所得稅政策問題的通知》（財稅[2009]27號）文規(guī)定，自2008年1月1日起，企業(yè)在為本企業(yè)任職或者受雇的全體員工支付的補充醫(yī)療保險費，在不超過職工工資總額5%標準內(nèi)的部分允許稅前扣除。
三、未參加社會統(tǒng)籌等其他情況醫(yī)療費用的稅前扣除
根據(jù)國稅總局《關(guān)于企業(yè)工資薪金及職工福利費扣除問題的通知》（國稅函[2009]3號）文規(guī)定：職工福利費用的支付范圍包括”企業(yè)向職工發(fā)放的因公外地就醫(yī)費用、未宴行醫(yī)療統(tǒng)籌企業(yè)職工醫(yī)療費用、職工供養(yǎng)直系親屬醫(yī)療補貼、供暖費補貼、職工防暑降溫費、職工困難補貼、救濟費、職工食堂經(jīng)費補貼、職工交通補貼等?！八?，對未實行醫(yī)療統(tǒng)籌企業(yè)所發(fā)生的醫(yī)療費、企業(yè)向職工發(fā)放的因公外地就醫(yī)費用以及職工供養(yǎng)的直系親屬醫(yī)療補貼，屬于職工福利費用范圍中的一部分。對職工福利費用的總支出在工資總額14%的部分允許稅前扣除，對超過工資總額14%的部分不允許稅前扣除。
對于企業(yè)參加醫(yī)療統(tǒng)籌后，另外支付給在崗的、已參加醫(yī)療統(tǒng)籌人員的醫(yī)療費用不允許稅前扣除。
四、離退休人員統(tǒng)籌外醫(yī)療費用的稅前扣除
根據(jù)《財政部關(guān)于企業(yè)加強職工福利費財務(wù)管理的通知》（財企[2009]242號）文規(guī)定，離退休人員統(tǒng)籌外費用納入企業(yè)職工福利費開支范圍。另外，根據(jù)《財政部關(guān)于企業(yè)重組有關(guān)職工安置費用財務(wù)管理問題的通知》，按規(guī)定從重組前企業(yè)凈資產(chǎn)中預(yù)提離退休人員統(tǒng)籌外費用，由重組后企業(yè)承擔(dān)人員管理責(zé)任的，重組后企業(yè)發(fā)放或支付的離退休人員統(tǒng)籌外費用，從預(yù)提費用中直接核銷，不作為企業(yè)職工福利費；企業(yè)實行分立式重組，將離退休人員移交存續(xù)企業(yè)或者上級集團公司集中管理，并將按規(guī)定預(yù)提的統(tǒng)籌外費用以貨幣資金形式支付給管理單位的，管理單位發(fā)放或支付的離退休人員統(tǒng)籌外費用，從專戶中列支，也不作為管理單位的職工福利費；企業(yè)在《財政部關(guān)于企業(yè)重組有關(guān)職工安置費用財務(wù)管理問題的通知》實施前完成重組，重組后企業(yè)將離退休人員移交上級集團公司集中管理，但當(dāng)時未預(yù)提并劃轉(zhuǎn)相應(yīng)資金的，重組后企業(yè)定期向上級集團公司繳納費用，應(yīng)當(dāng)納入職工福利費；上級集團公司代為支付的離退休人員統(tǒng)籌外費用，不納入上級集團公司職工福利費。
五、商業(yè)醫(yī)療保險稅前扣除
商業(yè)保險是在基本社會保險的基礎(chǔ)上，有經(jīng)濟能力和保險意愿的社會主體，為了進一步保障自身的權(quán)益，自主決定所投保的險種。雖然國家也提倡和鼓勵社會主體投保商業(yè)保險，但基于國家稅收利益上的考慮，以及實踐中的可操作性等角度出發(fā)，若允許企業(yè)對其為投資者或者職工向商業(yè)保險機構(gòu)投保的商業(yè)保險費支出稅前扣除，將造成不同盈利水平等狀況下的企業(yè)扣除范圍不一，稅負不均，因此，企業(yè)為其投資者或者職工向商業(yè)保險機構(gòu)投保的人身保險、財產(chǎn)保險等商業(yè)保險，不得扣除。但對企業(yè)按國家規(guī)定為特殊工種職工支付的法定人身安全保險費，以及國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定可以稅前扣除的商業(yè)保險費，準予稅前扣除。
一是企業(yè)按照國家規(guī)定為特殊工種職工支付的法定人身安全保險費。依據(jù)《企業(yè)所得稅法實施條例》第三十六條規(guī)定：”除企業(yè)依照國家有關(guān)規(guī)定為特殊工種職工支付的人身安全保險費和同務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定可以扣除的其他商業(yè)保險費外，企業(yè)為投資者或者職工支付的商業(yè)保險費，不得扣除?！霸谝恍┨厥庑袠I(yè)的企業(yè)中，從事特定工種的職工，其人身可能具有高度危險性。為了減少這些職工工作的后顧之憂，國家會強制性規(guī)定企業(yè)為這些職工投保人身安全保險，且從企業(yè)角度來看，通過保險能分散和減少其所承擔(dān)的責(zé)任，是其取得經(jīng)濟利益流入所發(fā)生的必要與正常的支出，也符合稅前扣除原則。為了鼓勵企業(yè)為特定工種職工投保人身安全保險費，落實國家有關(guān)規(guī)定的精神，有必要允許企業(yè)發(fā)生的這部分支出稅前扣除。此類保險費，其依據(jù)必須是法定的，即是國家其他法律法規(guī)強制規(guī)定企業(yè)應(yīng)當(dāng)為其職工投保的人身安全保險，如果不是國家法律法規(guī)所強制性規(guī)定的，企業(yè)自愿為其職工投保的所謂人身安全保險而發(fā)生的保險費支出則不準予稅前扣除。
二是國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定可以扣除的其他商業(yè)保險費。考慮到情況的復(fù)雜性，如企業(yè)因其職工出差而為職工購買的航空意外險費用支出等，目前也無法一一明確，而且需要根據(jù)實際情況的發(fā)展變化，作靈活調(diào)整。所以，法律可授予國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門相應(yīng)的權(quán)力，根據(jù)實際情況的需要，決定企業(yè)為其投資者或者職工投保商業(yè)保險而發(fā)生的哪些商業(yè)保險費，可以稅前扣除。
除上述兩種商業(yè)保險費外，企業(yè)為職工購買的其他商業(yè)保險既不允許直接在稅前扣除，也不允許作為福利費14%的基數(shù)計算扣除。
六、外商投資企業(yè)和外國企業(yè)境外繳納醫(yī)療保險的稅前扣除
外商投資企業(yè)和在中國境內(nèi)設(shè)立機構(gòu)、場所的外國企業(yè)按照有關(guān)國家（地區(qū)）社會保險制度的要求，或者作為企業(yè)內(nèi)部的福利或獎勵制度，直接或間接為其在中國境內(nèi)工作的雇員（含在中國境內(nèi)有住所和無住所的雇員）向境外保險機構(gòu)（包括社會保險機構(gòu)和商業(yè)保險機構(gòu)）支付人身意外傷害保險費、醫(yī)療保險費等其他名目的境外保險費不允許稅前扣除。因為《企業(yè)所得稅法實施條例》第三十五條規(guī)定，企業(yè)依照國務(wù)院有關(guān)部門或者省級人民政府規(guī)定的范圍和標準為職工繳納的保險準予扣除。相對應(yīng)不是依照我同法律繳納的醫(yī)療保險不允許稅前扣除。即企業(yè)不得列支其在中國境內(nèi)工作的職工的境外社會保險費。但境外保險費作為支付給雇員的工資、薪金的，可以根據(jù)《企業(yè)所得稅法實施條例》第三十四條規(guī)定，在企業(yè)應(yīng)納稅所得額中扣除。
