由財政部、衛(wèi)生部于1998年11月17日聯(lián)合制定發(fā)布，并于1999年1月1日起正式實施的《醫(yī)院會計制度》（以下簡稱舊制度）施行了將近十三年，在當時的經濟條件下對我國公立醫(yī)院的經濟發(fā)展起到了一定的作用，規(guī)范了公立醫(yī)院的會計核算行為，加強了公立醫(yī)院的財務管理。但是，隨著我國市場經濟的快速發(fā)展和醫(yī)療衛(wèi)生管理體制的不斷深化改革，舊制度漸漸難以滿足新形勢下推進公立醫(yī)院改革、加強公立醫(yī)院成本與績效管理的要求。因此，財政部于2010年12月31日制定發(fā)布了新的《醫(yī)院會計制度》（以下簡稱新制度），并規(guī)定于2011年7月1日起在公立醫(yī)院改革國家聯(lián)系試點城市施行，自2012年1月1日起在全國施行，舊制度同時廢止。新制度更加全面地體現(xiàn)了公立醫(yī)院的特點，對加強公立醫(yī)院成本核算、推行績效考核有著重大的意義。新制度到底新在哪里呢？
一、新制度大大提升了權責發(fā)生制的應用
由于受《事業(yè)單位會計準則》的限制，長期以來公立醫(yī)院會計實際上未能很好地采用權責發(fā)生制記賬基礎，新制度明確提出了完全采用權責發(fā)生制（僅財政補助收支例外）。這一修訂加強了公立醫(yī)院的獨立個體經營意識，起到了落實醫(yī)改意見、強化預算約束的效果，促進了收入、費用的合理核算，滿足了我國預算管理和財務成本管理的需要。
二、新制度明確了會計要素
盡管舊制度并沒有明文規(guī)定公立醫(yī)院的會計要素，但事實上是依照《事業(yè)單位會計準則》將資產、負債、凈資產、收入和支出等事業(yè)單位會計要素視為公立醫(yī)院會計要素的。而新制度明確指出公立醫(yī)院會計要素為資產、負債、凈資產、收入和費用。可見，原來的支出要素在新制度中由費用要素取代，這一改變肯定了醫(yī)院會計核算不僅有取得收入的事實，也有確認計量成本費用的需要。費用要素下新增的成本費用科目，使得相關的成本費用得以準確反映。比如管理費用，新制度下公立醫(yī)院的管理費用不再分攤至醫(yī)療或藥品支出中，而是單獨列示，這就能在報表上直觀的體現(xiàn)出醫(yī)院的管理水平和能力，改善了以往舊制度下無法對醫(yī)院管理費用進行衡量和定性的情況。
三、新制度健全了會計科目體系
新制度通過新增、廢除、合并、拆分、改變名稱或核算內容等方式，將會計科目從原來的43個更新為52個，同時完善健全了對應的確認條件、計量屬性和計價方法等。這規(guī)范了公立醫(yī)院各項資產、負債、凈資產
、收入和費用的核算與管理，更加符合公立醫(yī)院對交易或事項進行核算的需要，建立起了一套更加完備的公立醫(yī)院會計核算科目體系。比如說，在新制度中為醫(yī)院對外投資設置了“短期投資”、“長期投資”和“其他收入——投資收益”科目，其中長、短期投資的會計處理與企業(yè)對外投資類似，更加適應市場經濟環(huán)境，且醫(yī)院對外投資實現(xiàn)的投資凈收益單設其他收入的投資收益明細科目進行核算，有利于社會公眾了解公立醫(yī)院的收入組成，對醫(yī)院管理班子進行合理有效的監(jiān)督。
四、新制度建立了醫(yī)療成本核算體系
(一)完善了醫(yī)療成本的歸集與核算
新制度引入了全成本核算理念，完善了成本歸集核算體系，實現(xiàn)了成本控制的目標。新增的“醫(yī)療業(yè)務成本”科目核算醫(yī)院開展醫(yī)療服務及其輔助活動發(fā)生的各項費用，包括人員經費、耗用的藥品及衛(wèi)生材料費、自有資金形成的固定資產折舊費和無形資產攤銷費、提取醫(yī)療風險基金和其他費用等內容，并按照這些內容及歸屬的具體科室進行明細核算。新制度不僅明確成本的一級明細科目內容，而且強調以科室為對象，歸集直接成本進行明細核算，由此按照成本核算對象、范圍、口徑、方法等設置了一整套合理的體系；同時對成本進行事前控制，以提高醫(yī)院的資金使用效率，這也為醫(yī)院的會計核算和管理提出了更高的要求。此外，新制度還要求醫(yī)院財務報告中的醫(yī)院財務情況說明書至少應當對醫(yī)院的成本核算及控制情況作出說明并附有成本報表。
(二)真實反映了醫(yī)藥成本
舊制度區(qū)分醫(yī)療、藥品收支，對“藥品”采用售價核算。新制度廢除了“藥品收入”、“藥品支出”科目，改由“醫(yī)療收入”、“醫(yī)療業(yè)務成本”科目分別核算，結束了會計賬目上“藥品收支”的假象，使會計科目提供的會計核算資料更能真實反映醫(yī)院業(yè)務收支的實際情況，且在核算方面也更加簡潔明了；同時，廢除“藥品”科目，改用“庫存物資”科目核算，且計入“庫存物資”的藥品改為進價核算，廢除了“藥品進銷差價”科目，這一改變摧毀了“以藥養(yǎng)醫(yī)”機制，可以更加直觀地反映藥品的來龍去脈，符合現(xiàn)行醫(yī)改的要求。
(三)結合補償機制改變了固定資產折舊模式
舊制度對固定資產不計提折舊，新制度打破了原有思維，區(qū)分不同的資金來源進行折舊會計處理：使用財政補助資金購入固定資產分期計提折舊費計入“待沖基金”科目；使用自有資金購入固定資產分期計提折舊費計入“醫(yī)療業(yè)務成本”科目。這一改變促進了醫(yī)療成本核算范圍的進一步完善，更加準確地反映了醫(yī)療成本與醫(yī)療收入之間的配比關系，有效地夯實了醫(yī)療成本數據基礎；并且更好地體現(xiàn)了醫(yī)院的補償機制，有利于公立醫(yī)院按照預算管理要求對財政項目收支及結余進行核算。
1、使用財政補助資金購入固定資產有關分錄
購入時：
借：固定資產/在建工程
貸：待沖基金
借：財政項目補助支出
貸：財政補助收入
各期計提折舊時：
借：待沖基金
貸：累計折舊
2、使用自有資金購入固定資產有關分錄
購入時：
借：固定資產/在建工程
貸：銀行存款
